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シーケンサーなしでどうやって流行している変異株の割合判断するんだ？ｗｗｗｗ目視か？ｗｗ触診か？ｗｗ
東京都における新型コロナウイルスの全ゲノム解析（2022年6月～2023年5月）
www.tmiph.metro.tokyo.lg.jp/files/archive/issue/kenkyunenpo/uid_6385ad960b867/12
_nenpou74_Akane-NEGISHI.pdf
新型コロナウイルス感染症（COVID-19）は2019年12月に中国で初めて確認され，これまでに数多くの新型コロナウ
イルス（SARS-CoV-2）変異株が世界中で報告された．2022年1月から始まった第6波以降は，オミクロン株派生系統の
BA.1からBA.5，XBBまでの系統であり，各系統はさらに多くの亜系統に細分化している．東京都では変異株サーベイラ
ンスを目的に，SARS-CoV-2の全ゲノム解析を実施してきた．今回，2022年6月1日から2023年5月31日の間にNGS解析を
実施した113,505件を解析した結果，2022年6月まではBA.2系統が主流であり，2022年7月から2023年2月まではBA.5系統
のBA.5.2.1系統，2023年3月以降はXBB系統のXBB.1.5系統が主流となっていた．都内で検出されたXBB系統の系統樹解
析では，XBB.1.5系統，XBB.1.9系統，XBB.1.16系統のクレードと，XBB.2.3系統のクレードに大きく分かれ，それぞれ
海外株を含むクラスターを形成した．これらの結果より，全ゲノム解析から亜系統の分類を集計することがCOVID-19
の流行状況の詳細な把握に有用と考えられた．
